苦荞薄壳性紧密连锁SSR标记的开发及验证

苦荞(Fagopyrum tataricum)是我国重要的杂粮作物之一,其果壳类型不同导致脱壳效率不同,对苦荞产业发展有很大的影响.目前关于苦荞果壳类型的分子标记研究较少.为给苦荞果壳特性的改良及苦荞种质果壳类型的早期判断提供参考和选择依据,本研究开发并验证了与苦荞薄壳特性紧密连锁的SSR分子标记.结果表明,在薄壳基因1.4 Mb的定位区间内共扫描到286个SSRs,其中单核苷酸和二核苷酸重复类型数目最多,分别为92个和103个,出现次数最多的基序分别是A/T和AT/AT;SSRs重复次数大多集中在4～10次.共成功设计、合成了186对SSR引物,其中5对具有多态性的SSR标记与RILs群体的果壳类型形态学标记(a7GK)的连锁分析表明,SSR标记FtgGKssr-149和FtgGKssr-175与果壳类型连锁最紧密.对32个苦荞品种(系)果壳率和多态性SSR标记的关联分析表明,标记FtgGKssr-147、FtgGKssr-149和FtgGKssr-175与果壳率显著或极显著关联.本研究得到了3个与果壳类型紧密连锁以及和果壳率显著关联的SSR标记,可用于薄壳苦荞种质的分子标记辅助选择,对加速薄壳苦荞品种的育种进程具有重要意义.