2016-2019年山东省仔猪腹泻病原调查及PEDV分离株S基因遗传进化分析

本研究于2016年6月至2019年3月从山东省部分地区收集了 231例疑似猪流行性腹泻(PED)病猪样品,患病仔猪主要临床症状为发热、呕吐、水样腹泻、体质量减轻和脱水,并有较高的病死率.通过PCR/RT-PCR对样品进行相关腹泻病原检测.检测结果显示,猪流行性腹泻病毒(PEDV)阳性病料147份,阳性率为63.63％;猪圆环病毒2型(PCV2)检出率为16.88％(39/231);猪轮状病毒(PoRV)检出率为5.19％(12/231),猪传染性胃肠炎(TGEV)检出率为0.43％(1/231).本研究分离到7株PEDV,对其S基因序列进行遗传进化分析,结果显示,分离株与PEDV参考株的核苷酸序列同源性为93.1％～98.9％,氨基酸序列同源性为91.5％～98.7％.分离株与疫苗株CV777有不同程度的核苷酸和氨基酸位点突变,部分突变氨基酸位点位于PEDV抗原表位区域(COE)和抗原表位S1D5、S1D6中.本研究结果表明vPEDV在山东省广泛流行,是引起仔猪腹泻的主要病原因素,研制新型PEDV疫苗已迫在眉睫.