广东地区猪A型塞内卡病毒USA/GBI29/2015-like株的分离鉴定与进化分析
Heilongjiang Animal Science and Veterinary Medicine(2022)
摘要
为了了解广东地区猪A型塞内卡病毒(SVA)的遗传变异情况,试验采用病毒分离纯化、间接免疫荧光、增殖动态、电子显微镜观察等方法确定疑似病料感染情况,同时采用序列比对分析方法与GenBank中具有代表性的(SVA)全基因组序列进行同源性分析,利用MEGA6.0软件构建全基因组系统发育进化树.结果表明:分离的病毒能够和SVA多克隆抗体发生特异性反应,病毒粒子呈球形,直径25~30 nm,成功分离得到一株SVA毒株,命名为CH-GDZQ-1;CH-GDZQ-1毒株在感染PK15细胞第15小时时病毒效价达到峰值,为1×108.78 TCID50/mL;CH-GDZQ-1全基因组序列与USA/GBI29/2015株核苷酸相似性为98.1%,高度同源,该毒株与中国毒株CH-GDLZ01-2017(MG428680)、CH-GDLZ02-2017(MG428681)、CH-GDQC-2017(MG428682)、CH-GDYD-2017(MG428683)、CH-GDYS01-2017(MG428684)和CH-GDYS02-2017(MG428685)在同一个进化分支,同时与美国毒株USA/GBI29/2015(KT827251)处于同一个大的分支.说明成功分离一株USA/GBI29/2015-like毒株,该毒株具有较高的病毒效价,且在广东地区流行.
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