拟环纹豹蛛生物学特性及其基因组调查分析

目前蜘蛛的全基因组尚未在公共数据库中发表,仍处于不断探索阶段.为丰富蜘蛛基因组的研究内容,进一步促进蜘蛛基因组序列在公共数据库中的发表和使用,本研究对拟环纹豹蛛(Pardosa pseudoannulata)的形态、生物特性和基因组进行了分析.利用Illumina高通量测序技术对其进行基因组测序,采用K-mer 17分析法预测其基因组大小、杂合度和重复序列等基因组特征.研究表明,从基因组中获得了超过142.11 Gb的高质量数据,这些数据被组装成3508.13 Mb的contigs和3542.56 Mb的scaffolds.contigs的N50长度和总长度分别为1035 bp和3508.13 Mb,scaffolds的N50长度和总长度分别为1258 bp和3542.56 Mb.拟环纹豹蛛的基因组大小为4696.86 Mb,呈现出两个明显的峰值,其杂合子率为0.21％,重复率为84.32％.拟环纹豹蛛的基因组测序结果具有高度重复性,这表明在基因组测序之前的多代自交有利于降低重复性,并且NOVOheter可用于基因组组装.本研究为促进蜘蛛基因组数据的发表提供了基础,同时也为蜘蛛的基因组学研究提供了参考价值.