动脉粥样硬化斑块破裂的关键免疫相关基因和潜在治疗药物的识别

Journal of Jinan University(Natural Science & Medicine Edition)(2022)

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摘要
目的:本研究旨在识别可能与动脉粥样硬化斑块破裂(APR)有关的关键免疫相关基因和潜在治疗药物.方法:下载GSE41571、GSE120521和E-MTAB-2055数据集并合并为一个数据集.提取免疫相关差异表达基因(DEIRGs),并构建DEIRGs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,利用分子复合物检测(MCODE)插件筛选关键hub基因.然后,利用cMap预测靶向DEIRGs治疗AS斑块破裂的候选化合物,并将其与hub基因进行了分子对接.同时,评价了hub基因的诊断效能,并开展hub基因的单基因基因集富集分析(GSEA).结果:共获得29个DEIRGs,筛选出 8 个 hub 基因(即 CD14、CSF1R、FCER1G、FCGR3A、HCST、ITGB2、S100A9 和 TYROBP).cMap 预测结果显示,9个候选化合物表现出了靶向DEIRGs治疗APR的潜在作用.8个hub基因在合并数据集中的曲线下面积(area under the curves,AUCs)均大于0.7,提示其具有良好的诊断APR的效能.单基因GSEA显示,8个hub基因高表达组共同富集到了 B细胞受体信号通路、趋化因子信号通路、NOD样受体信号通等16个信号通路.结论:本研究发现了 8个hub基因在APR的进展过程中起关键作用,9个候选化合物表现出了靶向DEIRGs治疗APR的潜在作用,结果为后续从免疫学角度探索APR的机制及治疗提供了新的思路和切入点.
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