马疱疹病毒1型gp2基因分子特征
Chinese Journal of Veterinary Medicine（2022）
Abstract
为了探索α疱疹病毒亚科的马疱疹病毒特有基因gp2的功能及分子结构,本试验以EHV-1 XJ2015株为研究对象,扩增其gp2基因并测序,继而进行遗传进化分析、氨基酸序列差异性分析和蛋白质性质分析.结果显示,30株EHV-1病毒gp2蛋白氨基酸序列相似性达90.38％;gp2蛋白预测包括1个信号肽、1个螺旋跨膜结构域和1个核外运信号;gp2蛋白二级结构以无规卷曲为主,高达88％,极性分子居多,亲水性氨基酸占52.02％,第25-130位和第273-565位氨基酸亲水性和抗原性较强,易形成潜在的抗原表位.由此可见,gp2基因属于EHV-1较保守的基因,gp2蛋白是分泌型蛋白,且具有良好的抗原性.本试验为进一步解析EHV-1 gp2基因及其编码蛋白功能、制作基因工程疫苗和诊断试剂提供了生物信息学依据.
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