基于50K SNP芯片信息的枣庄黑盖猪群体遗传结构分析

枣庄黑盖猪是我国优良地方猪种,但其核心群体主要源于不同农户,遗传背景未知,给相关保护和利用工作带来了困难,近年来全基因组测序技术的发展使得从分子层面研究其群体遗传结构成为可能.本研究使用全基因组水平50K SNP芯片检测了枣庄黑盖猪核心群200头,其中公猪12头.结果表明枣庄黑盖猪群体平均亲缘系数与平均近交系数分别为0.0890和0.1117;12头公猪可分为6个血统,188头母猪分为6个家系;各家系平均亲缘系数范围为0.1413～0.2391,平均近交系数范围为0.0908～0.1462,群体近交水平较低,拥有较高的遗传多样性.本研究在全基因组水平上分析了枣庄黑盖猪的群体遗传结构,为后续的种群保护及开发利用提供了分子层面的依据.