糖尿病肾病患者两种不同组织差异基因的相关分析

目的 利用生物信息技术筛选糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)与肾小球组织的差异基因,筛选诊断DN的生物标志物和治疗的靶向基因.方法 从基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库GSE142153中提取DN患者和健康人PBMCs基因表达数据,从GSE30528芯片中提取DN患者和健康人肾小球基因表达数据,采用GEO在线分析软件GEO2R和Excel筛选差异表达基因.结果 DN患者的PBMCs中有201个差异表达基因,肾小球组织中有845个差异表达基因.PBMCs的差异基因主要参与DN肾脏炎症反应.肾小球组织的差异基因主要参与肾系统发育.两个组织中有以下基因同时差异表达,分别是 EMP1、MAFB、GADD45A、A TF3、RASL11B、F3、CCR2、TLR 7、EGF、TIPARP、P2RY14、CD24、IGKC、DACH1.其中 TLR7、CCR2、CD24、EGF、ATF3、MAFB、GADD45A、F3基因存在相互作用.结论 DN患者PBMCs和肾小球的差异基因不同,差异基因在DN中的作用机制也明显不同.有16个基因在DN的两个组织中同时差异表达,可以作为诊断DN的生物标志物.利用共有差异基因在PBMCs和肾小球中的表达规律,也许可以对DN进行无创检测.有8个共有差异基因在PBMCs和肾小球中互相作用,可以作为DN治疗靶点.