一株人轮状病毒G2P[4]型毒株的近似全基因组进化分析

目的:分析轮状病毒G2P[4]型2020BJ株的近似全基因组进化特征。方法:运用逆转录－聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)进行轮状病毒基因组扩增，将扩增产物测序，对所得序列进行系统进化和同源性分析。结果:获得人轮状病毒G2P[4]型2020BJ株近似全长的11个节段核酸序列，序列分析表明其为G2-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2基因型(DS-1-Like)；进化分析表明与日本、印度、孟加拉及意大利等国家毒株亲缘关系较近；亲缘关系较近的毒株间抗原表位的氨基酸存在差异。结论:与2020BJ亲缘关系较近的5株G2P[4]型轮状病毒VP7和VP4的抗原表位的氨基酸存在差异，可能导致流行特征不同，应加强轮状病毒监测。