基于数据库探索GPX4基因在泛癌中的潜在价值

目的 探索介导肿瘤铁死亡过程中的关键基因GPX4在泛癌中的潜在价值.方法 采用UAL-CAN和TIMER数据库分析GPX4基因的mRNA表达水平;cBioPortal分析GPX4在泛癌中的基因变异情况;GE-PIA分析GPX4表达与患者生存之间的关系;LinkedOmics分析靶向调控GPX4基因表达的MIR种类及KEGG通路分析;TIMER和GEPIA数据库研究GPX4基因与免疫细胞浸润的相关性及与免疫细胞标记基因的相关性.结果 GPX4基因在15种肿瘤组织中异常表达,12种癌组织中存在变异,其表达与结肠癌(COAD)、胃癌(STAD)及甲状腺癌(THCA)患者生存期相关,MIR-503及MIR-127共同正向调节COAD、STAD及THCA中GPX4的表达,14种MIR共同负向调节GPX4表达.在COAD、STAD及THCA中,GPX4参与氧化磷酸化、磷脂酰肌醇信号系统、赖氨酸退化、谷胱甘肽代谢、JAK-STAT信号通路及MicroRNAs调节等过程.在THCA中,GPX4与B细胞、CD4+T、CD8+T细胞及巨噬细胞浸润水平有相关性.结论 GPX4基因的表达、突变及调节与COAD、STAD及THCA的发生发展、患者的预后、肿瘤免疫有一定的相关性,为进一步研究其在泛癌中的作用奠定了基础.