基于单细胞RNA测序的人羊水间充质干细胞异质性分析

目的:利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)确定人羊水间充质干细胞(AF-MSC)的细胞亚群及各个亚群之间的异质性.方法:采集孕中期正常孕妇羊水样本,分离培养获得AF-MSC,使用10x scRNA-seq平台进行检测.对测序结果进行过滤、比较、量化、筛选等分析,根据基因表达情况进行降维聚类分群并判断细胞周期,对亚群进行差异基因分析并获得标记基因,预测不同亚组的分化能力,分析表面标志物的表达水平.结果:共检测到6717个细胞,根据基因表达情况将细胞聚类分为7个亚群.亚群4为非MSC,余亚群均为MSC.细胞周期影响亚群的聚类,不同细胞周期的细胞在各个亚群中占比不同.各个亚群的基因表达及分化能力不同,亚群5向各个方向分化的评分均较高,亚群4则均处于较低水平.结论:ScRNA-seq能够对人AF-MSC进行细致分群,精确反映各个亚群细胞间的差异.