基于网络药理学的铁皮石斛免疫调节作用机制

Journal of Zhejiang Agricultural Sciences(2022)

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摘要
研究表明,铁皮石斛在增强人体免疫力方面具有良好作用.为了明确铁皮石斛潜在的免疫活性成分及其作用机制,本研究从PubChem、SciFinder数据库中收集铁皮石斛小分子化合物及其化学结构相关的研究,然后通过Swiss ADME筛选优效目标化合物.通过Swiss Target Prediction预测优效化合物的靶点集,并通过Genecards数据库获取免疫调节相关靶点集,两者取交集得到铁皮石斛免疫调节相关靶点集,进一步通过Cytoscape软件建立化合物-靶点网络图,将交集靶点导入STRING构建蛋白互作网络(PPI),筛选出核心靶点.通过R的Cluster Profiler包对核心靶点进行功能富集分析,包括基因本体分析(GO)及通路富集分析(KEGG),最终建立化合物-靶点-生物功能网络.最终,共筛选出优效化合物124个,对应靶点421个;与免疫调节相关化合物58个,对应靶点60个;其中黄酮类化合物对应的免疫靶点较多,可能为主要的免疫活性成分.得到9个免疫调节相关核心靶点,GO分析发现这些核心靶点共参与了2059个条目,KEGG分析获得153个代谢通路.本研究通过化合物-靶点-生物功能网络展示了铁皮石斛多成分、 多靶点、 多通路的作用特点,为后续作用机制的深入研究和验证提供了可行方向.
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