基于SSR标记的野生黑木耳种质资源遗传多样性研究

野生黑木耳(Auricularia heimuer)种质资源丰富,具有许多优异的特性,是重要的遗传育种材料,利用基于黑木耳全基因组序列设计的30对SSR引物(24对为特异性强的引物,分布于已经构建的黑木耳遗传连锁图谱的8个连锁群上,其余6对为多态性好的引物)对收集自国内黑木耳主要分布地区(云南、吉林、黑龙江等8个省)、国外黑木耳主要分布地区(朝鲜、俄罗斯)的72个野生菌株进行遗传多样性分析.结果表明:30对SSR引物共检测到211个等位基因位点,每对引物扩增出的位点数为5～12个,多态性位点丰富,比率高达100％;30对SSR引物的平均Shannon's信息指数、观测杂合度、期望杂合度和多态性信息含量分别为1.532、0.469、0.722和0.717;供试菌株间遗传相似系数为0.056～0.951,有75.16％菌株间相似系数小于0.5;在相似系数为0.718处,可将菌株分为7个类群,其中JAUAH 214(吉林省)、JAUAH 251(云南省)、JAUAH 282(吉林省)、JAUAH 301(云南省)和JAUAH 386(朝鲜)均独立成群,菌株间差异极大.筛选出条带清晰、多态性信息含量高、能完全区分72个供试菌株,并可用于二维码指纹图谱构建的SSR核心引物9对.研究结果为黑木耳遗传育种及种质资源保护、智能化管理提供参考.