沙眼衣原体PmpH基因克隆及生物信息学分析

[目的]克隆沙眼衣原体PmpH基因并进行生物信息学分析.[方法]以沙眼衣原体核酸检测阳性泌尿生殖道标本为研究对象,设计引物扩增PmpH基因,克隆、测序后获得其全长核酸序列,应用生物信息方法预测分析编码蛋白的理化性质、主要结构域、结构及B细胞抗原表位.[结果]PCR扩增出沙眼衣原体PmpH基因,克隆并测序后获得PmpH基因核酸序列,长度为3 051 bp,预测PmpH蛋白理论分子质量为107.898 ku,等电点为6.05,该蛋白具有信号肽和2个结构域.PmpH蛋白二级结构主要为无规则卷曲,占比高达50.69％.预测该蛋白含有34条线性B细胞表位,其中氨基酸数大于7的有26个.[结论]克隆得到沙眼衣原体PmpH基因,预测PmpH蛋白分子量为107.898 ku,二级结构主要为无规则卷曲,含有34条线性B细胞表位(大于7个氨基酸的有26个).