2020—2021年我国部分省份禽呼肠孤病毒分子流行病学调查

近年来,禽呼肠孤病毒(ARV)在我国白羽肉鸡群中的感染率呈上升趋势,流行范围较广,给我国肉鸡养殖企业带来了较大经济损失.ARV易变异重组,因此全面了解其分子流行病学特征具有十分重要的意义.为了解我国白羽肉鸡群中ARV的遗传变异特点,2020—2021年从山东、河北、福建、安徽、辽宁、江苏等6个省份收集疑似ARV感染样品,采用RT-PCR方法筛选阳性样本,然后对阳性样本进行σC基因(1088 bp)测序,根据测序结果分析ARV不同基因型分布规律及占比.结果显示:2020—2021年,从6个省份中,经RT-PCR检测,检出ARV阳性样品157份,总阳性检出率为62.1％,不同省份的阳性检出率为44.4％～77.3％.157份阳性样品可分为6个基因型,其中基因1型61份(38.85％)、基因2型41份(26.11％)、基因3型15份(9.56％)、基因4型9份(5.73％),基因5型30份(19.11％),基因6型1份(0.64％);61份基因1型样品中,38份与标准ARV疫苗株(S1133)属于同一亚分支,另外23份与4599参考株处于单独的另一亚分支.结果表明:我国肉鸡群中存在一定程度的ARV流行;流行的ARV基因型较为复杂,且存在基因1型变异毒株,当前的疫苗株已不能对其提供足够的保护.结果提示,今后需要进一步开展ARV感染监测,评估其流行及变异情况,调整免疫策略,加快新疫苗等防疫技术及产品研发.本研究初步了解了我国部分省份的ARV分子流行病学特征,对我国ARV感染的防控具有重要意义,也为变异株新型疫苗研发提供了依据.