一株雀纹天蛾核型多角体病毒的鉴定及其基因组序列分析

Chinese Journal of Virology(2022)

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摘要
从自然死亡的雀纹天蛾幼虫分离到一株雀纹天蛾核型多角体病毒.通过扫描及切片透射电镜发现,该病毒为单粒包埋型核型多角体病毒,命名为ThjaSNPV(Theretra japonica single nucleopolyhedrovirus).病毒全基因组重测序后拼接显示,该病毒基因组全长134 899 bp,GC含量37.28%,与豆天蛾单粒包埋型核型多角体病毒株DZ1基因组序列相似性高达96.24%.ThjaSNPV含有131个开放阅读框(ORF)其中55个为正链基因,76个为负链基因,与宿主同为天蛾科的豆天蛾单粒包埋型核型多角体基因组相比,雀纹天蛾单粒包埋型核型多角体病毒新注释到7个基因:chitin-binding protein(ORF9),ODV-E18(ORF11),-lef-11(ORF27),hypothetical protein(ORF41),lef-10(ORF42),pif-6(ORF66),P6.9(ORF88).ThjaSNPV 的 DNA 光裂酶基因(DNA photolyase,ORF53)中不具有豆天蛾NPV中的1 bp碱基的缺失,只编码一个大的完整DNA裂合酶.38个串联的核心基因的进化分析显示雀纹天蛾NPV与Alphabaculovirus group Ⅱ类群聚类在一起,且和豆天蛾NPV最为相似.
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