基于网络铁死亡相关的长非编码RNA预测肝细胞癌患者预后研究

目的 探讨构建基于铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后风险模型预测肝细胞癌(HCC)患者预后的价值.方法 自癌症基因组图谱TCGA数据库下载HCC患者RNA测序数据.基于HCC差异水平的铁死亡相关ln-cRNAs构建预后风险模型.结果 鉴定了 5个基于HCC差异水平的铁死亡相关lncRNAs;Kaplan-Meier分析显示,高风险lncRNAs与HCC预后不良相关,预测3 a生存率的ROC曲线下面积(AUC)为0.873;单样本基因集富集分析(ssGSEA)发现低风险组与高风险组细胞溶解活性、MHCI类分子、Ⅰ型INF反应、Ⅱ型INF反应存在显著性差异(P＜0.05);免疫检查点显示,两组CD44、TNFRSF4和CD276等水平也存在显著性差异(P＜0.05).结论 通过生物信息学方法筛选出5个基于HCC差异水平的铁死亡相关lncRNAs构建的预后风险模型为HCC防治研究奠定了一定的基础.