白菜、甘蓝和甘蓝型油菜PAP1/2同源基因的鉴定及分析
Acta Horticulturae Sinica（2022）
摘要
PAP1/2转录因子是参与形成MBW复合体从而调控花青素合成的主要MYB转录因子.以拟南芥PAP1/2转录因子核酸和蛋白序列比对及Pfam验证,研究白菜、甘蓝和甘蓝型油菜等芸薹属植物中PAP1/2转录因子调控花青素代谢的确切同源拷贝数、进化关系及表达情况:在白菜、甘蓝及甘蓝型油菜中鉴定到的PAP1/2转录因子同源拷贝数分别为3、4和9个;通过进化分析和PAP1/2转录因子同源拷贝所在区段微共线性分析进一步明确了其不同拷贝间的进化关系,厘清了 A7和C6染色体上PAP1/2转录因子不同拷贝的相互关系;结合白菜、甘蓝和甘蓝型油菜不同组织转录组测序数据进行表达情况分析,阐明了 PAP1/2转录因子同源拷贝在不同组织中的表达情况.
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