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婴幼儿脓毒性休克的死亡预测基因:基于血液转录组学分析

Journal of practical shock(2022)

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摘要
目的 筛选婴幼儿(≤3岁)脓毒性休克的死亡预测基因.方法 通过检索NCBI-GEO数据库获取研究数据集,通过R语言及inSilicoMerging、limma等软件包筛选差异表达基因,通过STRING进行基因功能富集分析,通过二元logistic回归分析得到具有死亡预测价值的基因.结果 筛选得到13个差异表达基因,功能富集显示患儿的差异表达基因主要集中在中性粒细胞相关功能上;联合基因KCNJ15和XIST进行死亡预测的ROC曲线下面积为0.817(95%CI,0.731-0.902;P<0.01),具有较高的预测价值.结论 脓毒性休克婴幼儿的死亡可能与中性粒细胞功能相关的基因异常表达有关,KCNJ15和XIST可能是具有婴幼儿脓毒性休克死亡预测价值的基因.
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