草甸退化指示植物黄帚橐吾的质体基因组特征

黄帚橐吾是青藏高原高寒草甸生态系统广泛分布的毒杂草.在过度放牧的干扰下,黄帚橐吾功能性状适应作用还不清楚.为了解黄帚橐吾叶绿体基因组特征,本研究分析了其叶绿体基因组结构和基因构成特征,并进行系统演化基因组分析.结果表明:(1)黄帚橐吾叶绿体基因组的功能基因有134个,其中包括8个rRNA基因、37个tRNA基因和89个蛋白编码基因.(2)在黄帚橐吾叶绿体基因组的密码子组成中,RSCU值>1的密码子有30个,其中以A/U碱基结尾的有27个;RSCU值<1的密码子有32个,其中以G/C碱基结尾的密码子偏多,为29个.(3)在黄帚橐吾的叶绿体基因组中,检测出37个散在重复序列,包括17个正向重复序列和18个回文重复序列;检测到42个SSR位点.(4)通过最大简约法(MP)对黄帚橐吾及其近缘类群共计12个物种质体基因组构建系统发育树,结果显示黄帚橐吾可能是橐吾属中比较古老的物种.从而在分子层面更多地认识黄帚橐吾的遗传背景和种质资源鉴定,为环境适应性分析提供理论支持.