多房棘球蚴葡萄糖转运蛋白抗原表位生物信息学预测

目的 通过对多房棘球蚴葡 萄糖转 运蛋白(Echinococcus multilocularis glucose transporter,EmGLUT)二级结构的分析,并结合在线工具来预测优势T细胞和B细胞抗原表位.方法 从NCBI-Gen Bank库中获取EmGLUT基因的mRNA和氨基酸序列.二级结构特征预测使用SOPMA软件.使用IEDB、Syfpeithi软件分析T细胞优势抗原表位,使用Bcepred、AB-Cpred软件分析B细胞优势抗原表位.结果 分析结果显示,在EmGLUT二级结构中α螺旋比例占51.08％,β折叠比例占17.88％,β转角比例占3.73％,无规则卷曲比例占27.31％.综合5个在线软件分析结果得出EmGLUT有10个T细胞优势抗原表位和18个B细胞优势抗原表位,其中5个同时具有T-B细胞双抗原表位.结论 EmGLUT的优势T细胞和B细胞抗原表位被成功预测.