基于中国人群脑胶质瘤分子分型的转录组特征及其临床意义

目的:探讨基于中国人群的脑胶质瘤分子分型的转录组特征及其临床意义。方法:回顾性分析中国脑胶质瘤基因图谱(CGGA)数据库中932例全级别脑胶质瘤患者的转录组数据和临床资料。将其分为异柠檬酸脱氢酶(IDH，包括IDH1和IDH2)突变且染色体1p/19q共缺失(Mut_Co)型(182例)、IDH突变且染色体1p/19q非共缺失(Mut_nCo)型(315例)及IDH野生(WT)型(435例)3种分子分型。比较3种脑胶质瘤分子分型患者的诊断年龄、性别、组织病理学类型、美国癌症基因组图谱计划(TCGA)脑胶质瘤分型、脑胶质瘤CpG岛甲基化表型(G-CIMP)分型及肿瘤纯度的差异；探索3种脑胶质瘤分子分型的转录组学特征；分析3种脑胶质瘤分子分型参与的生物学通路以及癌症标志评分的差异。对具有转录组数据和完整随访数据的885例患者进行生存分析，绘制Kaplan-Meier曲线，比较3种脑胶质瘤分子分型患者生存期的差异。结果:与Mut_Co型和Mut_nCo型比较，WT型患者中，诊断年龄≥43岁、世界卫生组织(WHO)肿瘤分级为Ⅳ级、组织病理学为胶质母细胞瘤、TCGA分型中的经典型、G-CIMP分型中的非G-CIMP型所占比率均高，肿瘤纯度最低，差异均有统计学意义(均 P<0.001)。与Mut_Co和Mut_nCo型比较，WT型脑胶质瘤的内部侵袭和局部侵袭得分均高，细胞周期处于DNA合成期(S期)的比例高，差异均有统计学意义(均 P<0.001)；在WT型中，转录因子PAX3高表达，p53信号通路低表达。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路功能富集分析显示，Mut_Co和Mut_nCo型参与的生物学通路较广泛，主要参与刺激神经组织的配体受体的相互作用、长期的抑郁等生物学通路；广泛参与刺猬蛋白信号、WNT β CATENIN信号等癌症标志；WT型主要参与p53信号通路、黏着斑及凋亡等生物学通路及癌症标志。log-rank检验结果显示，Mut_Co型患者的生存期最长(大部分存活)，Mut_nCo型次之(中位生存期为1 258 d)，WT型生存期最短(中位生存期为415 d)，差异有统计学意义( P<0.001)。 结论:基于中国人群的3种脑胶质瘤分子分型具有不同的临床特征，且与TCGA分型及G-CIMP相关；不同分型具有特异的转录组学特征、参与特定的生物学通路及其癌症标志。不同分子分型的脑胶质瘤患者的预后不同。