四妙丸对Ⅱ型环氧合酶与黄嘌呤脱氢酶抑制作用的虚拟筛选研究

Acta Universitatis Traditionis Medicalis Sinensis Pharmacologiaeque Shanghai(2022)

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摘要
目的:探究四妙丸中作用于Ⅱ型环氧合酶(COX2)与黄嘌呤脱氢酶(XDH)的活性成分及结合机制.方法:使用受试者工作特征曲线(ROC)评估Libdock、Autodock对接软件对于COX2与XDH的灵敏性.从TCMSP数据库收集四妙丸中4味中药的有效成分,使用分子对接技术虚拟筛选出对COX2与XDH结合优于原配体的成分,使用分子动力学模拟技术分析结合后复合物的稳定性.结果:通过ROC曲线观察发现Libdock对接程序适用于COX2,而Autodock适用于XDH.分子对接实验结果表明,与COX2和XDH结合较佳的有效成分分别有6个和5个,其中(6Z,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-六甲基-2,6,10,14,18,22-廿四碳六烯与COX2对接打分最佳,黄芩素与XDH对接打分最佳.分子动力学模拟结果表明最佳配体均能与受体稳定结合.COX2与配体可稳定形成1-2个氢键,XDH与配体可稳定形成2~3个氢键.结论:四妙丸抑制COX2和XDH的活性成分有多种,最可能的有效成分分别为(6Z,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-六甲基-2,6,10,14,18,22-廿四碳六烯和黄芩素.
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