猪TRIM21基因克隆与序列分析

SONG Huixin, LI Shurou, YANG Liu, WU Wenqi, CHEN Ziqing,ZHANG Hang, ZHANG Jiajia,QIN Limei,ZHAO Mengmeng

MODERN ANIMAL HUSBANDRY（2022）

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Abstract

克隆猪三联基序21(Tripartite motif 21,TRIM21)基因,并对其进行序列分析和生物学功能预测.采用PCR技术扩增猪TRIM21基因,将其克隆至pCE2 TA/Blunt-Zero载体上.对猪TRIM21基因生物学功能进行预测,并对其理化性质进行分析.核苷酸相似性与进化树分析结果显示,猪TRIM21基因与黄牛核苷酸相似性为86.0％,亲缘关系最近,与斑马鱼核苷酸相似性为47.7％,亲缘关系最远;序列分析结果表明猪TRIM21基因序列全长1401 bp,编码469个氨基酸,编码蛋白的分子量为53.57 ku,理论等电点为6.07,属于亲水性蛋白.成功获得猪TRIM21基因序列,初步通过生物学信息学分析了猪TRIM21基因,为进一步揭示猪TRIM21基因的蛋白表达和免疫学特点提供理论依据.

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