基于生物信息学分析筛选骨肉瘤关键基因

目的:本研究采用生物信息学分析方法筛选骨肉瘤关键基因,预测骨肉瘤潜在治疗靶点.方法:选取GEO数据库中骨肉瘤数据集"GSE16088"和"GSE36001",利用GEO2R进行筛选差异基因.通过DAVID和KOBAS对差异基因进行生物过程分析和通路富集分析.使用STRING数据库、Cytoscape及其插件cytoHubba构建蛋白-蛋白相互作用网络,寻找关键基因.结果:通过分析共筛选229个共同差异基因(P.adj<0.05,|Log2FC|>1).通过Cytohubba筛选出排名前10的基因MMP9、TYROBP、PECAM1、SELL、SPP1、APOE、CXCL12、HP、PIK3R1、BTK为所得Hub基因.结论:该研究利用生物信息学筛选骨肉瘤关键基因,帮助理解其在骨肉瘤发病机制和发生发展过程中的作用,为寻找骨肉瘤新的治疗靶点提供思路.