251份藜麦种质资源遗传多样性及分子身份证构建

藜麦(Chenopodium quinoa Willd.)种质资源的准确鉴别是遗传多样性研究及藜麦种业和产业发展的前提和基础.本研究利用MultipSeq多重PCR扩增子捕获技术获得656个SNP,对251份藜麦种质资源进行遗传多样性分析,并利用perl脚本构建每份种质资源的DNA指纹图谱,基于指纹图谱信息构建个体分子身份证.群体遗传结构分析表明,251份种质资源被划分为2个类群Ⅰ和Ⅱ,分别对应安第斯高原型藜麦群和智利低海拔型藜麦群;类群Ⅰ、Ⅱ群体遗传多样性指数分别为0.0037和0.0036,群体分化指数为0.14;群体主成分分析结果与群体遗传结构分析结果完全一致,类群间存在部分遗传交叉现象;系统发育分析显示类群Ⅰ包括以玻利维亚、秘鲁为主的152份种质资源,类群Ⅱ包括以智利为主的99份种质资源,其中类群Ⅰ又进一步划分为Ⅰ-1和Ⅰ-2两个亚群,亚群Ⅰ-1、Ⅰ-2的Nei's遗传距离为0.054.112份河北石家庄种质材料中,40份与玻利维亚种质群亲缘关系较近、24份与秘鲁种质群亲缘关系较近、48份与智利种质群亲缘关系较近.本研究构建的251份藜麦种质材料分子身份证能够达到对种质材料溯源和保护的作用,同时群体遗传多样性分析结果对于我国藜麦种质资源划分和系统整理具有一定的参考意义.