广西辣椒病毒的sRNA深度测序和RT-PCR鉴定

采用小RNA(sRNA)深度测序技术,结合RT-PCR技术对广西9个辣椒主产区具有典型病毒病症状的病样进行检测,共发现10种病毒,其中小米椒内源RNA病毒1(Capsicum frutescens endornavirus 1,CFEV 1)、辣椒潜隐病毒 2(pepper cryptic virus 2,PCV 2)、烟草轻型绿花叶病毒(tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和辣椒黄脉病毒(pepper vein yellows virus,PeVYV)是在广西辣椒上首次发现,且CFEV 1在中国是首次发现.10种病毒在75份辣椒病样中的总检出率为8.00％～66.67％,前5位依次为辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV,66.67％)、甜椒脉斑驳病毒(pepper veinal mottle virus,PVMV,62.67％)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV,41.33％)、CFEV 1(32.0％)以及PCV 2(26.67％).ChiVMV、PVMV、CMV和CFEV 1在广西7～9个辣椒主产区广泛分布,推测为优势病毒.除桂林外,其他8个辣椒主产区均含以上4种优势病毒中的1～3种,但在桂林,这4种病毒的检出率偏低或检不出,其优势病毒种类是PMMoV和PCV2.广西辣椒病毒病复合侵染率为94.66％,3种(检出率42.67％)和4种(检出率24.00％)病毒复合侵染是主要形式.3种复合侵染中以ChiVMV+PVMV+CMV 和 ChiVMV+CFEV 1+ChiRSV 占比最高(均为 18.75％),4 种复合侵染中以 ChiVMV+PVMV+CMV+CFEV 1 占比最高(16.67％).