基于高通量测序技术分析菜心切口处微生物多样性

Food Science(2022)

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摘要
研究菜心冷藏期间的腐败微生物,使用高通量测序技术,对冷藏菜心切口处微生物的多样性进行分析,探究冷藏期间微生物菌群相对丰度的动态变化.以4℃冷藏菜心为研究对象,分析贮藏早期0d、中期7d、后期14 d的菜心切口处细菌的16SrRNA和真菌的ITS序列,比较各组菌群组成和丰度.通过物种注释评估和物种组成分析,明确菜心贮藏过程中切口处的优势菌群.在贮藏早、中、后期,真菌优势菌群均为担子菌门(Basidiomycota)、子囊菌门(Ascomycota)和unclassified Fungi.在贮藏早期,细菌优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria),而在贮藏中、后期,细菌优势菌群转变为厚壁菌门、变形菌门、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes).微生物多样性结果显示,真菌的多样性要高于细菌.本研究明确了菜心冷藏期间的微生物多样性发生规律,为后续菜心保鲜剂和保鲜技术的研究提供了理论支撑.
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