萨福克和湖羊杂交F1代与湖羊背最长肌转录组分析

试验比较分析萨福克与湖羊杂交F1代和湖羊纯繁羔羊背最长肌差异表达基因转录组,探索影响萨湖F1代和湖羊肉质的重要基因和关键代谢通路.采集10月龄萨福克与湖羊杂交F1代羔羊(SH)和湖羊纯繁羔羊(HH)背最长肌组织,利用RNA-seq技术进行基因转录组比较分析,差异表达基因qRT-PCR验证.结果显示:筛选出差异基因322个,得到GO数据库注释278个,参与生物过程(BP)、分子功能(MF)和细胞组成(CC)的分别为83、140和55个.得到KEGG数据库注释147个,参与216条通路,差异基因显著富集通路24条.通过查阅文献和对比分析,初步认为与肉质相关的通路为氨基酸的生物合成通路、甘油酯代谢通路、PPAR信号通路、MAPK信号通路和肌动蛋白细胞骨架的调节通路.筛选出与肉质相关的候选基因有LPIN1、CFL2、ENO3和AQP7.研究表明,在转录组水平上筛选出萨福克与湖羊杂交F1代、湖羊纯繁羔羊背最长肌差异表达基因322个,初步认为与肉质可能相关的通路11条,与肉质相关的候选基因4个.