基于生物信息学分析糖尿病肾病相关基因及信号通路的研究

目的:利用生物信息学方法分析参与肾小管上皮细胞(HK-2)相关的候选基因及其潜在机制.方法:数据来源于NCBI的Gene Expression Omnibus数据库,下载编号为"GSE30122"、"GSE142153"的芯片数据.本研究使用R语言中GEO query包下载GEO芯片矩阵及临床信息,采用stringr、dplyr及limma等程序包对基因芯片数据进行质量分析.识别相关差异表达基因,然后对这些差异表达基因进行KEGG通路富集分析.结果:通过差异分析,共得到251个差异基因,其中上调基因174个,下调基因77个.结论:对差异基因进行KEGG富集分析,共得到37条KEGG通路富集结果,发病机制与Rheumatoid arthritis、Pertussis、NF-kappa B 信号 通路、Complement and coagulation cascades、Staphylococcus aureus infection 信号 通路等有关.糖尿病肾病发病是由多途径造成的,这也为临床医生提供了其潜在的治疗手段.