分子动力学模拟研究温度对蛋白质结构稳定性的影响

目的:研究环境温度对蛋白质体系的影响.方法:以大肠杆菌二氢脂酰胺脱氢酶为样本,利用NAMD软件构建不同温度下的蛋白质模型,采用分子动力学对体系进行模拟.研究其在不同温度下,体系的能量及结构稳定性.结果:研究表明,体系静电势能和范德华能随外部温度的影响呈相反的变化趋势,但由于静电势能变化更明显,在非键相互作用中起决定作用.蛋白质的二级稳定结构α螺旋会在高温下逐渐解旋.蛋白质的均方根偏差和均方根涨落值分析显示温度越高,蛋白质的结构稳定性减弱,柔性增强.结论:这些研究成果为更好的理解蛋白质在不同温度下的结构转变并为热稳定行为提供了理论依据.