肠球菌CRISPR-Cas系统基因结构的分析及其与耐药基因的关系

CRISPR-Cas系统是一种细菌的适应性免疫系统,参与特异性防御不同类型的可移动遗传元件,如质粒、噬菌体、转座子等的入侵.旨在分析肠球菌(Enterococcus)基因组中该系统的基因结构,并探讨其与细菌耐药基因之间的关系.NCBI数据库中下载10种肠球菌的全基因组信息,利用软件对CRISPR-Cas系统的分布、cas1基因、重复序列、间隔序列等进行比对分析;查找耐药相关基因,分析其与CRISPR-Cas系统之间的关系.235株肠球菌中含完整CRISPR-cas系统的有35株(14.9％),含确定CRISPR阵列196个和cas基因簇46个.肠球菌基因组中CRISPR系统主要为II-A型(80.4％),其次是II-C型(15.2％),cas1基因序列的系统发育分析结果与CRISPR-cas系统的分型基本一致.肠球菌CRISPR-Cas系统的分布在不同菌种之间差异较大;CRISPR-Cas系统可能阻碍肠球菌某些耐药基因的水平转移.