陆地棉OFP基因家族的全基因组鉴定及表达分析
Science in China(Series C)（2022）
Abstract
OVATE Family Protein(OFP)是一类植物特异性转录因子,广泛参与植物的生长发育,其在棉花中的研究尚未见报道.本研究从陆地棉NDM8基因组中共鉴定到61个GhOFP基因,系统聚类将其分为6个亚组(Clade Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ和Ⅵ).转录组和qRT-PCR分析表明,棉纤维发育的起始和伸长阶段高调表达的GhOFP基因主要分布在Clade Ⅱ亚组,且该亚组的GhOFP基因启动子含有促进伸长生长的赤霉素和生长素响应的顺式元件;在棉纤维发育的次级细胞壁加厚阶段高调表达的GhOFP基因主要分布在Clade Ⅵ亚组,且该亚组的GhOFP基因启动子含有参与细胞壁生长的脱落酸、茉莉酸和水杨酸响应的顺式元件.陆地棉GhOFP基因家族的全基因组鉴定和分析将为进一步研究棉花GhOFP基因在棉纤维发育过程中的生物学功能提供参考.
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gene family,cotton,&,lt,italic&,gt,ofp&,lt,/italic&,gt,genome-wide
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