莆田黑鸭PMEL17基因的克隆、组织表达与多态性分析

为研究莆田黑鸭前黑素小体蛋白(PMEL17)基因序列特征,分析其在不同羽色鸭毛囊及莆田黑鸭不同组织中的表达情况,以莆田黑鸭毛囊组织为材料,利用cDNA克隆技术获得PEMLl7基因编码区全长序列并进行生物信息学分析;利用荧光定量PCR技术检测PMEL17基因在毛囊、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肌胃、肾脏、大脑、胸肌、腿肌和皮肤组织中的表达情况.结果表明,莆田黑鸭PMEL17基因编码区全长1 917 bp,其同源性与鸡最近,与其它物种变异性较大;PMEL17基因编码638个氨基酸,二级结构以无规则卷曲和延伸链为主,预测为稳定的疏水性蛋白,存在1个跨膜区;PMEL17基因在黑羽毛囊中表达,在白羽毛囊中不表达,莆田黑鸭各组织中仅在毛囊和皮肤表达,其它组织几乎不表达;在第6外显子处发现2个SNP位点,导致天冬氨酸突变成丙氨酸.试验结果为进一步研究PMEL17基因在鸭羽色形成中的作用奠定基础,也为莆田黑鸭种质特性研究提供数据.