奶牛TLR2基因核苷酸突变位点筛选及序列特征分析
Genomics and Applied Biology（2020）
摘要
采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,对中国荷斯坦牛TLR2基因CDS区核苷酸突变位点进行筛选,构建TLR2基因系统进化树,通过生物信息学方法预测并分析中国荷斯坦牛TLR2蛋白的理化性质及结构特征.结果 表明,中国荷斯坦牛TLR2基因CDS区共有5个核苷酸突变位点(T189G,G455A,A631G,C1632T和T1707C),且中国荷斯坦牛与新疆褐牛、野牛高度同源(99.2％).序列特征分析结果表明,中国荷斯坦牛TLR2蛋白由784个氨基酸组成,并同时含有亮氨酸重复序列(LRRs)和Toll同源结构域(TIR)的不稳定亲水性跨膜功能蛋白质.本研究结果揭示了TLR2基因结构特点和蛋白质理化性质,为该基因作用机理的深入研究和牛的抗病育种提供理论基础.
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