静原鸡ELOVL5基因功能生物信息学分析
Genomics and Applied Biology（2020）
摘要
极长链脂肪酸延伸酶蛋白家族(elongation of very-long-chain fatty acids,ELOVLs)是合成脂肪酸过程中的重要限速酶,主要调控血糖、血脂及一些代谢疾病的发生.为探究宁夏地方品种静原鸡ELOVL5基因编码蛋白的结构与功能,本试验根据GenBank中己公布的原鸡ELOVL5基因序列,针对8个外显子区域设计特异性引物,经DNA混合池扩增、测序后,对其编码区进行功能生物信息学分析.结果 表明,静原鸡ELOVL5基因编码区全长1 023 bp,编码340个氨基酸;ELOVL5蛋白存在1个低复杂度保守序列及7个跨膜结构域,25个磷酸化位点,9个B细胞抗原表位,与acidPPc、BC10、RasGEFN蛋白存在部分重叠区域(41～142 aa,72～125 aa,207～336 aa),为非分泌型的稳定水溶性蛋白,空间结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;亚细胞定位结果显示ELOVL5蛋白可能在线粒体内行使重要的生物学功能.该研究结果为后续ELOVL5蛋白功能的深入研究提供科学依据.
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