2017-2019年昆明市A(H1N1)pdm09亚型流感病毒血凝素基因特征分析

Modern Preventive Medicine(2021)

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摘要
目的 分析2017-2019年昆明市A(H1N1)pdm09亚型流感病毒血凝素基因特征,为流感防控提供科学依据.方法 2017-2019年昆明市流感监测网络实验室用MDCK细胞培养A(H1N1)pdm09核酸阳性样本,经血凝和血凝抑制鉴定获得13株A(H1N1)pdm09流感毒株,选取8株提取RNA,一步法扩增得到全基因组,纯化、定量、建库后上机二代测序,使用MEGA X、PhyML 3.1等软件进行基因特征分析和系统进化树构建.结果 昆明市2017年毒株与A/Michi-gan/45/2015同属于6B.1分支;2018、2019年毒株与A/Brisbane/02/2018同属于6B.1A分支.与当年疫苗株相比,2017年毒株新增4个突变,其中A73S位于Cb区;2018年毒株新增5个突变,其中S74R、S164T位于Cb、Sa区,2019年毒株新增11个突变,其中N156K、L161I位于Sa区,T185I、D187A、Q189E位于Sb区.N156K可导致免疫逃逸,D187A、Q189E同时位于190螺旋.结论 昆明市A(H1N1)pdm09流感病毒的突变位点逐年增加,尤其是抗原决定簇和受体结合部位的突变频率明显加快,提示我们应该持续加强流感监测,及时发现免疫逃逸与高致病性突变.
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