基于网络药理学和分子对接研究平贝母中生物碱的抗炎作用
Chinese Traditional Patent Medicine(2022)
Abstract
目的 通过网络药理学和分子对接等技术,探究平贝母中生物碱的抗炎作用及其机制.方法 通过TCMSP数据库和UniProt KB数据库,筛选出平贝母活性成分及其对应靶点;在GeneCards、OMIM、数据库中获取抗炎的相关靶点;采用Cytoscape软件构建成分-靶点-通路网络;运用String数据库构建蛋白质相互作用网络图(PPI);通过R语言进行GO和KEGG富集分析;并使用AutoDock vina 4.2软件进行分子对接.结果 与平贝母抗炎作用相关的化合物共有14种,对应靶点共32个;PPI结果显示核心靶点主要包括CASP3、IL-6、JUN、TNF、NR3C1和IL-1β等;GO功能分析表明平贝母生物碱可能通过调节细胞核受体活性、激活转录因子活性、调节G蛋白偶联的神经递质受体活性、调节乙酰胆碱受体活性和类固醇激素受体活性等发挥作用;KEGG通路分析显示平贝母生物碱可能通过TNF信号通路、IL-17信号通路、NF-κB信号通路、MAPK信号通路等通路发挥作用.分子对接结果显示,平贝母生物碱与抗炎蛋白具有较低的结合能.结论 通过网络药理学和分子对接技术初步探究了平贝母生物碱中抗炎作用的化学成分和作用机制,为今后的研究提供了一定的科学依据.
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