2007-2018年云南省急性弛缓性麻痹病例肠道病毒A71型基因特征

目的 分析云南省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例肠道病毒A71型(Enterovirus A71,EV-A71)的基因特征.方法 收集云南省2007-2018年AFP病例EV-A71阳性分离株,对分离株进行VP1编码区逆转录-聚合酶链反应扩增和核苷酸序列测定,分析核苷酸同源性和基因亲缘关系.结果 从2007-2018年云南省AFP病例中分离获得46株EV-A71,与A、B、C基因型代表株和云南省既往其他来源的分离株之间的核苷酸同源性分别为80.6％-83.0％、81.4％-85.4％、85.4％-99.1％、81.7％-99.8％;同年份分离株之间的核苷酸差异在2018年3株的0.63％至2014年9株的3.75％之间,不同年份分离株之间的核苷酸平均差异在1.77％-7.81％之间;基因亲缘进化分析显示,分离株与C4a基因亚型代表株处于同一分支.结论 云南省2007-2018年AFP病例的EV-A71分离株均为C4a基因亚型,与本省其他来源EV-A71分离株的基因亲缘关系相近.