耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌噬菌体F19的分离鉴定和全基因组分析

目的 分析1株耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌噬菌体F19的生物学特性和全基因组. 方法 从肺炎患者痰液分离肺炎克雷伯菌为宿主菌分离噬菌体F19,电镜观察其形态,并绘制生长曲线,观察F19对温度及pH值的敏感性.分析F19全基因组序列,预测可能存在的开放读码框.根据F19全基因组序列构建系统进化树,进行比较基因组学分析.结果 分离到1株新型的肺炎克雷伯菌噬菌体,命名为F19,F19可在其宿主菌菌苔上形成裂解性噬菌体所具有的完全透明的滴斑.电镜观察F19具典型的有尾噬菌体目短尾病毒科病毒形态特征.一步生长曲线显示F19的潜伏期为12min,裂解量为(102±13) PFU/细胞.F19全基因组长43 766 bp,(G+C)％的含量为53.8％.预测和注释F19全基因组51个开放读码框(ORF),按照功能分为DNA复制及调控模块,噬菌体结构基因模块,裂解宿主蛋白模块3大类.比较基因组学分析F19与短尾噬菌体科Drulisvirus属噬菌体基因组具有明显相似保守框架,一致性较强.噬菌体DNA酶基因进化分析表明F19属于Drulisvirus属成员. 结论 从污水中分离鉴定1株新的耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌噬菌体F19,在生物学分类上属于Drulisvirus属噬菌体,为噬菌体治疗耐碳青霉烯肺炎克雷伯感染奠定了基础.