PFGE与MLVA在福建地区肠炎沙门菌分子分型中的应用与评价

Journal of Parasitic Biology(2021)

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摘要
目的 比较和评价脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)和多位点可变数目串联重复序列分析技术(ML VA)在福建地区肠炎沙门菌分子分型中的应用价值.方法 采用PFGE和MLVA技术对福建地区88株肠炎沙门菌分离株进行分子分型,结合流行病学资料分析比较分型效果.结果 88株肠炎沙门菌经PFGE分型后,相似度系数为43.9%~100.0%,得到46个PFGE型别(PT 0001~PT 0046)2个优势型别簇(cluster A~B),分辨系数(D值)为0.9459.PT 0002 PT 0011、PT 0013和PT 0029为优势PFGE;经MLVA分型后,遗传关联度介于26.8%~100%之间,得到40个MLVA 型别(MT 0001~MT 0040),2个优势基因簇(cluster 1~2),分辨系数(D 值)为0.9235.MT 0005、MT 0004和MT 0014为优势MLVA型别.结论 PFGE分辨力略高,与流行病学背景资料更吻合;MLVA在分析菌株之间亲缘关系和遗传相关性方面更具优势.
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