以RNA聚合酶为靶点的抗槟榔黄化病毒药物虚拟筛选

[目的]基于槟榔黄化病毒的RNA依赖性RNA聚合酶筛选抗槟榔黄化病毒先导化合物.[方法]使用基于片段的药物设计方法,从PADFrag农药分子片段子库中筛选出14个片段作为骨架进行生长,得到140个分子,取11个CDOCKER得分靠前的分子进行分子动力学模拟和MM/GBSA计算以评估这些分子与RNA依赖性RNA聚合酶的亲和力,最后确定2个优选分子作为潜在的抗槟榔黄化病毒先导化合物.[结果]2个优选分子能以范德华力、静电相互作用以及氢键等方式与靶点稳固结合,有潜在的抗槟榔黄化病毒活性.[结论]2个优选分子可作为先导化合物用于新型抗槟榔黄化病毒药物开发.