80份陆稻晚稻农家种资源的遗传多样性综合分析

为保护和利用陆稻农家种资源,本研究利用SNP标记和表型鉴定对80份陆稻晚稻农家种资源进行遗传多样性综合分析.结果表明:利用水稻1KSNP芯片对80份资源进行检测后共获得739个SNP的基因型数据,基于SNP的群体结构分析、PCA分析和聚类分析,均将80份资源分为云南亚群(63份)、海南亚群(11份)和贵州亚群(6份)共3个亚群,3个亚群间的平均遗传距离分别为0.83、0.63、0.80,其中海南亚群与其他2个亚群的遗传距离较远.贵州的陆稻资源分别属于贵州亚群和云南亚群,表明黔南地区的陆稻资源可能存在不同的来源.云南亚群可进一步分为3个亚群,平均遗传距离分别为0.30、0.28和0.22,表明细分亚群间的遗传距离很近.表型鉴定结果表明,11个表型性状的变异系数在4.09％～38.77％之间,其中有效分蘖数和穗重的变异系数较大,均超过25.00％,株高、种子长、种子宽、种子长宽比和种子圆度均值变异系数较小,均低于10％;遗传多样性指数范围为1.76～2.84,种子长的遗传多样性最丰富.相关分析结果表明,11个表型性状间存在着复杂的相关关系,其中种子长宽比与圆度均值的相关系数最高为0.98.在表型PCA分析中,前5个因子累计贡献率为82.37％,可反映表型性状的绝大部分信息,各成分的贡献率分别为29.08％、23.42％、12.35％、9.77％和7.75％,主要反映了株型和产量相关信息.80份资源的综合得分范围为0.15～0.73,排名前10的种质资源(ZRG36、ZRG101、ZRG58、ZRG31、ZRG1、ZRG102、ZRG104、ZRG63、ZRG29、ZRG11)均来自海拔较高地区,其中2份来源于海南,5份来源于贵州,3份来源于云南,且在穗长、种子长、种子宽、穗重和千粒重表现较好.该研究结果为陆稻农家种资源的保护和利用提供了参考.