传染性支气管炎病毒山西分离株的分离鉴定及其S1基因分子特征分析

鸡传染性支气管炎(IB)是目前对养禽业造成严重危害的疫病之一,其病原为传染性支气管炎病毒(IBV).IBV由于其基因组的特点而易于发生变异和重组,从而产生新的变异株.为了解山西地区IBV的流行及变异情况,本研究采集山西省晋中市疑似发生呼吸道病毒感染的肉鸡组织病料样品,通过PCR鉴定、鸡胚接种及测序,分离鉴定到1株IBV,命名为CK/Shanxi-01/2021.在该分离株S1基因测序的基础上,与NCBI数据库中不同基因型IBV代表株进行序列比对,并构建系统进化树.遗传演化分析结果显示本研究所分离到的IBV为GI-19基因型.将CK/Shanxi-01/2021株的S1基因序列与IBV常用疫苗株H120、M41、H52、4/91及LDT3-A等进行序列比对分析,结果显示分离株与目前常用疫苗株核苷酸序列的同源性为78.1％～85.2％,氨基酸序列同源性为75.2％～78.4％,与以往GI-19基因型病毒株相比其S1蛋白高变区(HVR)出现了V68I、S120A、A271T、N282T、N291S等突变.由此可见,加强IBV流行病学监测,及时掌握目前流行的IBV基因型及其变异特点,对于IB疫情防控具有重要意义.本研究为山西省地区IB疫情防控提供了参考依据.