特发性肺纤维化相关的微阵列鉴定基因和microRNA分析

目的 通过特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)的微小RNA(microRNA,miRNA)-mRNA相互作用网络识别微阵列鉴定基因和miRNA.方法 使用从基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库(GSE27430和GSE135065)下载的IPF患者数据选择差异表达的miRNA和mRNA.使用转录因子富集分析选择miRNA,并使用miRDB、miRTarBase和TargetScan过滤miRNA的靶mRNA.使用Cytoscape软件可视化miRNA和mRNA之间的网络并计算Hub基因.使用GO和KEGG途径分析调节网络中的mRNA.结果 共选择21个miRNA和119个mRNA,重建由3个miRNA和3个mRNA组成的miRNA-mRNA网络.hsa-miR-199a-5p、hsa-miR-299-5p、hsa-miR-338-3p、NTNG1、SCN2A、TM6SF1被确定为关键的调节因子.结论 发现了IPF发病机制中涉及的几个重要的Hub基因和miRNA,其中hsa-miR-199a-5p/NTNG1和hsa-miRV299-5 p/SCN2 A途径可能在IPF中起重要作用,可以帮助识别病因,并提供潜在的治疗靶点.