基于微卫星标记的山西糜子资源DNA二维码创建

通过鉴定糜子种质资源,构建分子身份证,旨在为其保护遗传多样性提供理论依据,以来源于山西黄土高原生态区的21份糜子资源为材料,利用12个SSR标记(六碱基、五碱基和四碱基核苷酸重复序列分别为1、4、7对)筛选出9个遗传稳定性高、重复性好的标记,进行遗传多样性分析,利用相关软件构建材料的DNA二维码.结果表明,21份材料在12个位点的遗传多样性参数的观测等位基因平均为3.0000;有效等位基因介于2.5412～2.9959,平均为2.8412;多态性信息含量介于0.6010～0.7720,平均为0.7076;多样性指数介于0.9958～1.0979,平均为1.0661;观测杂合度介于0.5294～0.8883,平均为0.7058;期望杂合度介于0.6238～0.6842,平均为0.6646;Nei′s期望杂合度介于0.6065～0.6662,平均为0.6469.3个核心标记(RYW5、RYW8、RYW11)与其他标记相比相似系数过高,进行剔除处理;基于9个标记(RYW1、RYW2、RYW3、RYW4、RYW6、RYW7、RYW9、RYW10和RYW12)可以将21份材料全部区分.利用条形码在线软件与在线二维码技术分别构建了21份糜子资源的条形码和二维码.