肿瘤微环境中免疫与基质细胞相关基因在肺腺癌中的预后价值
Journal of Tianjin Medical University(2022)
摘要
目的:鉴别与肺腺癌预后相关的免疫与基质细胞基因.方法:501例肺腺癌基因表达数据来自癌症基因组图谱(TCGA)数据库.肺腺癌样本的免疫和基质评分从ESTIMATE数据库中获取.χ2检验分析基质、免疫评分与患者临床病理特征的相关性.采用t检验以及Cytoscape中的Mcode模块筛选差异表达基因(DEGs).采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线.结果:基质细胞评分与M分期显著相关(χ2=6.391,P=0.011).免疫评分与M分期(χ2=4.769,P=0.029)、T分期(χ2=11.672,P=0.009)和总生存期(χ2=6.334,P=0.009)显著相关.基于免疫评分的DEGs有262个,基于基质评分的DEGs有391个.基因功能富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络分析差异表达基因,富集分析表明,DEGs参与调节免疫应答、抗原结合、免疫应答和受体结合.生存分析表明POSTN(P=0.0181)、PLEK(P=0.0434)、LY86(P=0.0136)、HCK(P=0.0487)对肺腺癌患者具有预后价值.结论:基质细胞相关基因POSTN高表达与患者不良预后相关,免疫细胞相关基因PLEK、LY86、HCK高表达预示患者预后较好.
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