苎麻kinesin基因家族全基因组鉴定与表达分析
Plant Fiber Sciences in China（2022）
Abstract
驱动蛋白(Kinesin)家族是一类蛋白质超家族,属于分子马达蛋白中非常重要的一种,参与细胞分裂、生长和形态发生等植物生长发育过程.文章通过生物信息学方法,从苎麻全基因组中鉴定得到57个kinesin基因家族成员,依据苎麻基因注释的结果将其命名,所有kinesin蛋白均含有KISc结构域.苎麻kinesin蛋白的分子量分布范围为15893.8～325534.9 Da,氨基酸大小为142～2857 aa,等电点范围在4.79～10.44,外显子个数为3～42.顺式作用元件预测结果分析表明,BnKINs含有茉莉酸甲酯、赤霉素、脱落酸、生长素、水杨酸等激素响应元件.qRT-PCR结果发现,大多数基因在节间完全伸长区的茎皮中表达量较高.该研究为苎麻kinesin家族的功能验证奠定基础,并为后续筛选苎麻纤维发育候选基因提供依据.
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