从江田鱼肠道微生物多样性分析

对不同养殖时间点(1 d、2个月、5个月)的从江田鱼肠道细菌进行了测序分析.结果表明,RS1(1 d)和RS3(5个月)组样品肠道细菌多样性高于RS2(2个月)组.门水平分析,RS1组样品中厚壁菌门(Firmicutes,33.43％)、蓝细菌(Cyanobacteria,28.15％)、变形菌门(Proteobacteria,22.94％)和拟杆菌门(Bacteroidetes,9.79％)为主要优势菌;RS2组样品中的优势菌门为变形菌门,所占丰度为94.05％,其次为厚壁菌门(2.58％)、梭杆菌门(Fusobacteria,2.05％)和放线菌门(Actinobacteria,0.68％).RS3组样品中优势菌门为蓝细菌(40.69％)、变形菌门(31.65％)、梭杆菌门(10.30％)和厚壁菌门(8.89％).属水平分析,RS1组微生物多样性较高,未分类的蓝细菌(unidentified Cyanobacteria,28.11％)丰度最高,其次为Romboutsia(13.33％)、未分类的梭菌属(unidentified Clostridiales,8.37％)、鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas,4.62％)等菌属.RS2组样品中,气单胞菌属(Aeromonas)相对丰度最高,为68.86％.RS3组样品中,未分类的蓝细菌相对丰度最高,为40.63％;其次是气单胞菌属(12.41％)、鲸杆菌属(Cetobacterium,10.20％)等菌属.研究结果表明,稻田养殖系统中从江田鱼的肠道细菌群落在不同生长阶段变化明显.