侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析

[目的]分析侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒(Cactus virus X,CVX)及其NTU株系的基因组序列遗传变异,为建立分子检测和防控体系奠定理论基础.[方法]对感染病毒的样品采用宏转录组测序和生物信息学分析,分离病毒基因组序列并分析分子变异和系统进化.[结果]获得4条CVX(CVX-LW、CVX-RF、CVX-ZNS 和 CVX-ZYP)和5条 CVX-NTU(CVX-NTU-LW、CVX-NTU-RF、CVX-NTU-ZNF、CVX-NTU-ZNS和CVX-NTU-ZYP)贵州火龙果分离物近全长基因组序列,长度为6 494～6 603 bp,覆盖参考基因组96.2％～99.6％;CVX贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.3％～98.6％,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.1％～98.0％;CVX-NTU贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.1％～98.8％,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.6％～99.1％;CVX和CVX-NTU群体未出现明显的遗传分化.[结论]研究获得的CVX和CVX-NTU贵州火龙果分离物近全长基因组序列表现较高的一致性,未发生明显遗传变异.